Publication d’un ensemble de données en libre accès sur le cerveau des macaques —


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  • Des chercheurs de l’Institut néerlandais des neurosciences (NIN) ont publié un ensemble de données enregistrées à partir du cortex visuel de singes au repos. L’ensemble de données peut être partagé avec d’autres chercheurs pour analyse, utilisé comme matériel pédagogique et/ou servir de modèle pour de futures publications de grands ensembles de données d’électrophysiologie, donc moins de singes sont nécessaires pour la recherche. L’ensemble de données a été collecté au NIN et préparé pour publication par le NIN et des collaborateurs de l’Université de Juelich et de l’Université d’Aix-la-Chapelle (Allemagne).

    L’ensemble de données se compose de données d’électrophysiologie qui ont été enregistrées à partir du cortex visuel (V1 et V4) de deux singes, à partir de 1024 sites d’enregistrement simultanément pendant l’état de repos, et il comprend également des ensembles de données à l’appui obtenus pendant que les singes effectuaient des tâches visuelles. Les données fournissent une image de l’activité neuronale dans de vastes régions du cortex visuel à une résolution spatiale et temporelle sans précédent, avec une couverture de champ réceptif à haute densité. L’ensemble de données comprend des données sous leur forme « brute », pour permettre leur utilisation la plus large, ainsi que des données traitées pour faciliter l’analyse des signaux neuronaux couramment utilisés.

    Image détaillée spatialement et temporellement

    Les enregistrements peuvent être utilisés pour observer les ondes cérébrales dans de plus grandes régions du cortex, offrant une image spatio-temporelle détaillée de l’activité cérébrale.  » Dans cet article, nous fournissons l’ensemble de données, décrivons les formats de données brutes et traitées et les méthodes d’acquisition de données, et indiquons comment les données peuvent être utilisées pour fournir de nouvelles informations sur l’activité « de fond » qui influence le traitement de l’information visuelle dans notre cerveau », déclare Xing Chen, chercheur principal au laboratoire Vision et Cognition du NIN.

    La plupart des études ont soit examiné l’activité de l’état de repos dans tout le cerveau à l’aide d’IRM – une technique d’imagerie médicale non invasive – soit en enregistrant l’activité d’un petit nombre d’électrodes implantées. Le laboratoire Vision & Cognition, dirigé par le professeur Pieter Roelfsema, a effectué des enregistrements de plus d’un millier d’électrodes implantées de manière chronique dans le cortex visuel de primates non humains, produisant un ensemble de données sur l’état de repos avec une résolution spatio-temporelle élevée – une observation très détaillée et précise . « Une partie de notre ensemble de données a déjà été utilisée avec succès pour étudier les corrélats neuronaux de l’activité cérébrale obtenus par imagerie non invasive », déclare Chen.

    Libre accès

    Un article sur le descripteur de données accompagne l’ensemble de données. L’article comprend une description détaillée des connaissances scientifiques qui pourraient être obtenues à partir des données, des formats de données et des méthodes d’acquisition et de traitement des données. Sont inclus des sections sur les enregistrements de données (décrivant l’utilisation des données et les formats de fichiers) ; Validation technique (pour valider l’utilisabilité et l’exactitude des données) ; et Disponibilité du code (décrivant les scripts utilisés pour la collecte, le traitement et l’analyse des données).

    « Cet ensemble de données permet à d’autres scientifiques d’obtenir de nouvelles connaissances neuroscientifiques fondamentales sur l’activité sous-jacente qui influence le traitement de l’information visuelle dans notre cerveau », explique Chen. L’ensemble de données a été publié sous une licence Creative Commons en libre accès pour d’autres chercheurs afin que tout le monde puisse accéder aux données.

    Source de l’histoire :

    Matériaux fourni par Institut néerlandais des neurosciences – KNAW. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.

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