Aucun lien entre l’Homme de Florès et les pygmées modernes de Florès
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Une population pygmée près de la grotte où des fossiles d’Homo floresiensis ont été découvert semble avoir évolué en une petite taille indépendamment de l’Homme de Florès.
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Deux populations pygmées sur la même île tropicale. La première s’est éteinte il y a des dizaines de milliers d’années et la seconde y vit encore. Est-ce que les deux ont des liens communs ? Il a fallu des années pour apporter une réponse à cette question. Comme personne n’a été capable de récupérer l’ADN des fossiles de l’Homo floresiensis (surnommé le hobbit), les chercheurs ont dû créer un outil pour trouver des séquences génétiques archaïques dans l’ADN moderne.1
Sommaire
Contourner le manque d’ADN de l’Homme de Florès
La technique a été développée par des scientifiques dans le laboratoire de Joshua Akey, un professeur d’écologie et de biologie évolutive et l’Institut Lewis-Sigler de génomique intégrative à l’Université de Princeton. Dans votre génome et dans le mien, il y a des gènes que nous avons hérité de Néandertaliens selon Serena Tucci, une chercheuse postdoctorale dans le laboratoire d’Akey. Certains humains modernes ont hérité des gènes de Denisovans (une autre espèce humaine éteinte), que nous pouvons vérifier parce que nous avons des informations génétiques de Denisoviens.
Dans cette illustration, le village pygmée moderne, Rampasasa, est montré à gauche; au centre, un pygmée Rampasasa moderne portant le couvre-chef et les vêtements traditionnels est juxtaposé au visage d’une reconstruction d’Homo floresiensis; à droite, les éléphants pygmées jouent dans la grotte de Liang Bua où des fossiles H. floresiensis ont été découverts en 2004 – Crédit : Matilda Luk, Office of Communications, Princeton University
Mais si vous voulez chercher une autre espèce, comme Floresiensis, alors nous n’avons rien à comparer, nous avons donc dû développer une autre méthode. Nous “peignons” des morceaux du génome basés sur la source. Nous analysons le génome et nous cherchons des parties d’espèces différentes telles que Néandertal, Denisovans ou autre chose. Les chercheurs ont utilisé cette technique avec les génomes de 32 pygmées modernes vivant dans un village près de la grotte de Liang Bua sur l’île de Flores en Indonésie où on a découvert des fossiles de H. floresiensis en 2004.
Analyse sur les pygmées modernes de Florès
Ils ont beaucoup de parties provenant de Neandertal selon Tucci, qui était le premier auteur du papier publié dans la revue Science. Ils ont un un peu du Denisovan et nous nous y attendions, car nous savions qu’il y avait une migration qui allait de l’Océanie à Flores, donc il y avait une ascendance partagée de ces populations. Mais il n’y avait pas de parties chromosomiques d’origine inconnue.
Cette image montre les hauteurs relatives d’un Indonésien moderne (158 centimètres), un pygmée moderne vivant sur l’île de Flores (147 centimètres) et Homo floresiensis (106 centimètres, qui est la hauteur d’un Américain moyen âgé de 4 ans) – Crédit : Dr. Serena Tucci, Department of Ecology and Evolutionary Biology, Princeton University
S’il y avait une chance de connaître génétiquement l’Homme de Florès à partir des génomes d’humains existants, alors on aurait vu des choses selon Richard Ed Green, professeur agrégé d’ingénierie biomoléculaire à l’Université de Californie-Santa Cruz (UCSC) et un auteur correspondant sur le papier. Mais nous ne le voyons pas, il n’y a aucune indication de flux de gènes du hobbit dans les personnes vivant aujourd’hui.
Aucun lien entre Homo Floresiensis et les pygmées modernes
Les chercheurs ont trouvé des changements évolutifs associés à l’alimentation et à la petite taille. La taille est très héréditaire et les généticiens ont identifié de nombreux gènes avec des variantes liées à une taille plus grande ou plus courte. Tucci et ses collègues ont analysé les génomes pygmées de Flores en ce qui concerne les gènes associés à la taille identifiés chez les Européens et ils ont trouvé une fréquence élevée de variantes génétiques associées à une petite taille.
Cela semble être un résultat sans importance, mais c’est en fait très significatif selon Green. Cela signifie que ces variantes génétiques étaient présentes chez un ancêtre commun des Européens et des pygmées de Flores. Et ils sont devenus plus petits par sélection agissant sur cette variation stationnaire déjà présente dans la population, donc on n’avait pas besoin de gènes d’un hominien archaïque pour expliquer leur petite taille.
Le nanisme insulaire
Le génome pygmée de Flores a également montré des signes de sélection dans les gènes des enzymes impliquées dans le métabolisme des acides gras, appelées enzymes FADS (acide gras désaturase). Ces gènes ont été associés à des adaptations alimentaires chez d’autres populations piscivores, y compris les Inuits au Groenland. Les preuves fossiles indiquent que H. floresiensis était significativement plus petit que les pygmées Flores modernes, avec une taille de 106 centimètres, ce qui est plus court que le qu’un enfant américain moyen à la maternelle. En revanche, les pygmées modernes mesuraient en moyenne 145 centimètres. Floresiensis différait également de H. sapiens et H. erectus dans leurs poignets et leurs pieds, probablement en raison de la nécessité de grimper aux arbres pour échapper aux dragons de Komodo selon Tucci.
Les changements spectaculaires de taille chez les animaux isolés sur les îles sont un phénomène commun, souvent attribué à des ressources alimentaires limitées et à l’absence de prédateurs. En général, les grandes espèces tendent à devenir plus petites et les petites espèces ont tendance à grossir sur les îles. À l’époque de H. floresiensis, Flores abritait des éléphants nains, des dragons géants de Komodo, des oiseaux géants et des rats géants, qui ont tous laissé des ossements dans la grotte de Liang Bua.
Les îles sont des endroits très spéciaux pour l’évolution selon Tucci. Ce processus, le nanisme insulaire, a abouti à de plus petits mammifères, comme l’hippopotame et les éléphants et de plus petits humains. Leurs résultats montrent que le nanisme insulaire est apparu indépendamment au moins deux fois sur l’île de Flores selon les chercheurs, d’abord chez H. floresiensis et de nouveau chez les pygmées modernes.
