Le chromosome X est réduit au silence dans certains cancers masculins

“Pour équilibrer l’expression des gènes entre les sexes, dans le développement normal, une copie du chromosome X féminin est inactivée au hasard dans le corps humain. Nous voulions savoir si ce processus qui se produit dans le développement normal tourne mal chez les hommes ou les femmes génétiquement instables. cellules cancéreuses féminines », explique l’auteur principal Srinivas Viswanathan, généticien du cancer et oncologue médical au Dana-Farber Cancer Institute.

En utilisant des ensembles de données accessibles au public comprenant des milliers d’échantillons d’ADN de patients atteints de cancer du monde entier, l’équipe de chercheurs est tombée sur la forte expression de XISTE — le gène responsable de l’arrêt de l’expression génique sur le chromosome X — dans environ 4 % des échantillons de cancer masculin analysés.

Alors que XISTE peut être exprimé au tout début du développement chez tous les sexes, l’inactivation de X est considérée comme un processus spécifique à la femelle plus tard dans le développement. Il a été précédemment montré que certaines cellules cancéreuses féminines peuvent perdre la capacité de désactiver l’un des chromosomes X, entraînant une augmentation de l’expression du gène lié à l’X, mais cette capacité d’inactivation de X n’avait encore été étudiée que principalement dans les cellules féminines.

Parmi les 4 % d’échantillons de cancers masculins anormaux identifiés, 74 % provenaient de cancers de la reproduction dont il a déjà été démontré qu’ils inactivaient le chromosome X, mais cela laissait 26 % d’échantillons d’autres types de cancer. Ceux-ci comprenaient les cancers du foie, du cerveau, de la peau, du cœur, du poumon et de la thyroïde.

“Nous avons été très surpris par ce résultat puisque XISTE est une transcription généralement utilisée pour classer les cancers féminins, et nous voulions donc nous assurer qu’il ne s’agissait pas simplement du résultat d’une mauvaise annotation. Pourtant, nous constatons en fait que certains cancers masculins de divers sous-types activent XIST et présentent des caractéristiques d’inactivation de X », explique Viswanathan.

“Nous devons être conscients des mises en garde de travailler avec ces types d’ensembles de données. Ces échantillons ont été entre les mains de nombreuses personnes, et il y a plus de place pour l’erreur humaine”, a déclaré l’auteur co-correspondant Cheng-Zhong Zhang, biologiste du cancer au Institut du cancer Dana-Farber. “C’est la plus grande source d’incertitude pour nous ; nous devons être créatifs dans la façon dont nous examinons les données et trouvons des contrôles.”

Une explication possible de la raison pour laquelle ce phénomène se produit est l’instabilité génétique. Les cancers ont souvent plusieurs copies de chromosomes, et si deux chromosomes X se trouvent dans une cellule, il peut être nécessaire d’inactiver l’un d’eux en activant XISTEque cette cellule soit chez un individu féminin ou masculin.

“Une autre possibilité est qu’il existe des gènes importants sur le chromosome X qui, lorsqu’ils sont réduits au silence, permettent au cancer de se développer. Nous étudierons cela dans de futures études”, déclare Viswanathan.

“D’une certaine manière, le sexe est le biomarqueur ultime en ce sens qu’il subdivise la population humaine, mais nous ne pensons souvent pas à la façon dont les différences génétiques entre les sexes peuvent éclairer le pronostic du cancer ou la réponse au traitement”, déclare Viswanathan.

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Matériel fourni par Presse cellulaire. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.