Dresser un tableau plus complet de l’activité des médicaments en analysant plus d’un type de données


  • FrançaisFrançais



  • Un nouveau papier dans Systèmes cellulaires explore l’importance d’utiliser plusieurs types de données dans la découverte de médicaments. L’article examine plus de 1 000 médicaments testés en six doses et démontre que l’expression des gènes et la morphologie cellulaire fournissent des informations différentes pour la hiérarchisation des médicaments.

    Dirigée par le spécialiste des données biomédicales Gregory Way, PhD, MS, l’étude montre qu’en utilisant simultanément ces deux types de données, les scientifiques peuvent mesurer des aspects fondamentalement différents de la biologie du médicament.

    « Nous pensons que ces deux méthodes populaires peuvent être utilisées à notre avantage dans la conception de médicaments qui répondent à toute la complexité de la biologie », a déclaré Way, qui est professeur adjoint en informatique biomédicale au campus médical d’Anschutz de l’Université du Colorado.

    Way et une équipe de scientifiques des données ont découvert que les deux types de données fournissent une vision partiellement partagée mais également complémentaire des mécanismes de la drogue. Ils ont déclaré que l’utilisation des deux approches peut faire progresser la découverte de médicaments, la génomique fonctionnelle et la médecine de précision dans des directions uniques.

    « Bien que l’étiquetage des médicaments en fonction du mécanisme d’action soit incroyablement puissant, l’approche risque de passer à côté d’une vue d’ensemble. Les deux types de données, collectées via le dépistage phénotypique des médicaments, englobent la complexité de la biologie et peuvent permettre aux scientifiques d’étudier et d’exploiter les effets multiformes que les médicaments peuvent offrir. « , ajoute Way.

    Leur article montre comment les tests se comparent les uns aux autres sur des tâches biologiques utiles (par exemple, la prédiction du mécanisme d’action) compte tenu de toutes les sources de variation/bruit et des meilleures pratiques actuelles en matière de traitement des données. L’approche de dépistage phénotypique des médicaments permet aux chercheurs de mesurer des milliers de caractéristiques de milliers de médicaments différents en une seule expérience.

    « Nous espérons que notre analyse pourra guider les chercheurs dans la conception expérimentale et dans la compréhension des limites de leur modalité de profilage particulière afin de fournir des mesures plus cohérentes et de maximiser le potentiel de succès de la découverte de médicaments », a déclaré Way.

    L’article guide les scientifiques dans la planification d’expériences qui profilent les cellules pour inverser les phénotypes de la maladie, quantifier la réponse cellulaire aux perturbations chimiques ou génétiques et interroger les mécanismes des médicaments.

    Source de l’histoire :

    Matériaux fourni par Campus médical d’Anschutz de l’Université du Colorado. Original écrit par Julia Milzer. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.

    N'oubliez pas de voter pour cet article !
    1 étoile2 étoiles3 étoiles4 étoiles5 étoiles (No Ratings Yet)
    Loading...
    mm

    La Rédaction

    L'équipe rédactionnelle

    Laisser un commentaire

    Votre adresse e-mail ne sera pas publiée. Les champs obligatoires sont indiqués avec *