Incubateur ou barrière ? Explorer les liens entre l’agriculture, la biodiversité et la propagation des agents pathogènes

L’agriculture est souvent accusée d’accélérer ce processus, connu sous le nom de débordement zoonotique, à travers la déforestation et la fragmentation des habitats qui réduisent la biodiversité et augmentent la probabilité de contact entre la faune sauvage infectée et les humains.

Mais dans un article de Perspectives publié en ligne le 15 septembre dans la revue Une Terrel’écologiste Ivette Perfecto de l’Université du Michigan et ses collègues affirment que l’agriculture peut à la fois aider et entraver : elle peut agir comme un incubateur de nouveaux microbes d’origine animale, facilitant leur évolution en agents pathogènes prêts pour l’homme, ou elle peut former des barrières qui aident à bloquer leur propagé.

Pour éviter la propagation et les retombées des zoonoses à l’avenir, il est important de promouvoir des pratiques agricoles qui stimulent la biodiversité et créent des barrières contre les agents pathogènes, tout en minimisant les conditions qui forment des incubateurs, selon les auteurs.

“Beaucoup de gens supposent que l’agriculture est toujours en conflit avec la conservation de la biodiversité, mais ce n’est pas toujours le cas”, a déclaré Perfecto, professeur à l’École de l’environnement et du développement durable de l’UM.

“Il est vrai que les monocultures industrielles à grande échelle sont connues pour détruire la biodiversité. À mesure que la biodiversité diminue localement, la collection d’animaux normalement riche en espèces est réduite à quelques espèces susceptibles d’héberger des agents pathogènes qui peuvent déjà être – ou certainement avoir le potentiel d’évolution vers des agents pathogènes pouvant infecter les humains.

Par exemple, les monocultures de maïs attirent de grandes populations de souris, qui ont tendance à héberger des agents pathogènes zoonotiques potentiels. Les plantations de palmiers à huile attirent de grandes populations de chauves-souris qui se nourrissent de fruits de palmier. Les chauves-souris et les souris sont des sources généralement connues de zoonoses, définies comme des infections ou des maladies transmissibles des animaux aux humains.

En revanche, les paysages avec des exploitations agricoles diversifiées et à petite échelle « sont beaucoup plus susceptibles d’éviter les problèmes majeurs associés à l’agriculture industrielle », a déclaré Perfecto, qui, avec l’écologiste John Vandermeer de l’UM, a passé plus de trois décennies à étudier les relations entre la biodiversité et la biodiversité. conservation, lutte biologique contre les ravageurs et souveraineté alimentaire dans les plantations de café biologique au Mexique et à Porto Rico.

En matière de conservation de la biodiversité, les plantations de café biologiques ombragées battent les plantations de café au soleil intensif, tout comme les systèmes agroforestiers à plusieurs étages surpassent les plantations forestières monoculturelles.

“À l’heure actuelle, il existe une simplification excessive de la réalité sociale complexe qui a un impact sur la propagation des maladies”, a déclaré Luis Chaves, co-auteur de l’étude, de l’Université d’Indiana. “La plupart des maladies en sont affectées. Pourquoi avons-nous des points chauds de transmission dans certaines zones mais pas dans d’autres, malgré des environnements similaires ? C’est parce que le paysage change et le fonctionnement de la société dans son ensemble sont importants. Comprendre cela et recadrer nos pensées est impératif pour prévenir futures pandémies. »

Dans leur article Perspectives, Perfecto et ses collègues présentent un nouveau « cadre matriciel agricole » qui peut être utilisé pour examiner la relation entre l’agriculture et les zoonoses. Le cadre fait la distinction entre différents types d’agriculture et examine comment les caractéristiques de la matrice modulent l’abondance et la diversité des espèces, ainsi que les interactions entre espèces, qui facilitent ou inhibent l’évolution d’un agent pathogène capable d’infecter les humains, et la propagation ultérieure de cet agent pathogène dans les villes. .

“Pour minimiser l’émergence de maladies zoonotiques, nous soutenons qu’il faut se concentrer sur l’ensemble de la matrice agricole à travers le paysage, avec les règles qui en découlent en matière de facteurs écologiques et sociopolitiques”, a déclaré Perfecto.

Les facteurs sociopolitiques sont rarement pris en compte dans les débats en cours parmi les écologistes sur la propagation des maladies. Mais au 21ème siècle, la différence entre les matrices agricoles de mauvaise et de haute qualité a souvent moins à voir avec la biologie des organismes vivant dans un paysage qu’avec les forces sociopolitiques et économiques en jeu, selon Perfecto et ses collègues.

Les chercheurs affirment que le cadre proposé peut conduire à des actions cohérentes, pratiques et efficaces qui abordent les problèmes interconnectés de sécurité et de souveraineté alimentaire, de conservation de la biodiversité, d’émergence de maladies, de changement climatique et de pauvreté.

D’autres auteurs de l’article Perspective dans Une Terre sont Gordon Fitch de l’Université du Massachusetts, Amherst ; Zachary Hajian-Forooshani, Nicholas Medina, John Vandermeer et Alexa White du département d’écologie et de biologie évolutive de l’UM ; Benjamin Iuliano de l’Université du Wisconsin ; Kevin Li, Jonathan Morris, Iris Rivera-Salinas et Kimberly Williams-Guillén de l’UM School for Environment and Sustainability ; Beatriz Otero Jiménez de l’Université de Floride centrale ; et Chenyang Su du Dartmouth College.

Une partie de l’étude a été menée par Chaves alors qu’il était chercheur au sein du programme NIH Climate and Health Scholars. Chaves, Perfecto, Vandermeer et Li ont été partiellement financés par la National Science Foundation des États-Unis.